AART, Platformlar Arası Proteomik Çeviriyi Hızlı ve Doğru Bir Şekilde Sağlıyor

Doktor Özeti: PlazmaPlazmaKanın pıhtılaşma faktörlerini de içeren, hücrelerinden arındırılmış sıvı kısmı. proteomikProteomikBir organizma veya sistemdeki tüm proteinlerin yapısını, işlevini ve etkileşimlerini inceleyen bilim dalı. profillemesi; biyobelirteç keşfi, hastalık tahmini, teşhis ve hasta sınıflandırmasında yaygın olarak kullanılmaktadır. Ancak Olink, SomaScan ve kütle spektrometrisi gibi farklı analiz platformları arasındaki teknik farklılıklar, düşük-orta düzeyde uyumluluğa yol açarak çalışmaların tekrarlanabilirliğini ve veri entegrasyonunu sınırlamaktadır. Bu çalışmada, eşleştirilmiş protein ridge regresyonu ile proteomProteomBir organizma, doku veya hücre tarafından belirli bir zamanda ifade edilen proteinlerin tamamı. genelinde rezidüel öğrenmeyi entegre eden 'AART' adlı yeni bir platformlar arası proteomikProteomikBir organizma veya sistemdeki tüm proteinlerin yapısını, işlevini ve etkileşimlerini inceleyen bilim dalı. çeviri çerçevesi sunulmuştur. Üç bağımsız kohortKohortBelirli bir ortak özelliği olan ve belirli bir zaman dilimi boyunca takip edilen hasta veya birey grubu. ve üç ana platform üzerinde test edilen AART, doğrudan eşleştirmeye kıyasla ortalama %92,0, en güçlü temel yöntem olan cpiVAE'ye kıyasla ise %31,6'ya varan oranda daha iyi performans göstermiştir. AART tarafından doğru şekilde çevrilen proteinlerin hücre dışı, vezikül ilişkili ve dokuya özgü plazmaPlazmaKanın pıhtılaşma faktörlerini de içeren, hücrelerinden arındırılmış sıvı kısmı. biyolojisi için zenginleştiği saptanmıştır. Klinik uygulamaKlinik uygulamaLaboratuvar ortamında geliştirilen tıbbi yöntemlerin veya ilaçların, hastalar üzerinde tedavi edici amaçla kullanılması süreci.larda AART, tip 2 diyabet için ilişkilendirme analizlerinin tekrarlanabilirliğini %75,5, Alzheimer hastalığı için ise %370,6 oranında artırmıştır. ALS (amyotrofik lateral skleroz)ALS (Amyotrofik Lateral Skleroz)Beyin ve omurilikteki motor sinir hücrelerinin kaybıyla karakterize, kas erimesi ve güç kaybına yol açan ilerleyici bir nörodejeneratif hastalık. için kohortKohortBelirli bir ortak özelliği olan ve belirli bir zaman dilimi boyunca takip edilen hasta veya birey grubu. entegrasyonu, entegrasyon yapılmayan analize kıyasla teşhis doğruluğunu %92,6 oranında artırmıştır. Ayrıca AART, cpiVAE yöntemine göre bir ila üç kat daha hızlı çalışarak büyük ölçekli biyo-banka uygulamalarını kolaylaştırmaktadır.

Önemli Bulgular: AART; Olink, SomaScan ve kütle spektrometrisi gibi farklı proteomikProteomikBir organizma veya sistemdeki tüm proteinlerin yapısını, işlevini ve etkileşimlerini inceleyen bilim dalı. platformları arasındaki verileri yüksek doğrulukla çeviren yeni bir çerçevedir. Doğrudan eşleştirmeye kıyasla ortalama %92,0, en güçlü alternatif yöntem olan cpiVAE'ye kıyasla ise %31,6'ya varan performans artışı sağlamıştır. Tip 2 diyabet ilişkilendirme analizlerinin tekrarlanabilirliğini %75,5, Alzheimer hastalığı için ise %370,6 oranında iyileştirmiştir. ALS (amyotrofik lateral skleroz)ALS (Amyotrofik Lateral Skleroz)Beyin ve omurilikteki motor sinir hücrelerinin kaybıyla karakterize, kas erimesi ve güç kaybına yol açan ilerleyici bir nörodejeneratif hastalık. teşhis doğruluğunu, kohortKohortBelirli bir ortak özelliği olan ve belirli bir zaman dilimi boyunca takip edilen hasta veya birey grubu. entegrasyonu sayesinde %92,6 oranında artırmıştır. AART, cpiVAE yöntemine göre bir ila üç kat daha hızlı çalışarak büyük ölçekli biyo-banka uygulamalarına olanak tanımaktadır.