ALS İlişkili RNA-Bağlayıcı Proteinlerde Alternatif Poliadanilasyon Değişikliklerinin Kısmi Yakınsaması

Doktor Özeti: Bu çalışma, amiyotrofik lateral skleroz (ALSALSBeyin ve omurilikteki motor sinir hücrelerinin kaybıyla karakterize, kas erimesi ve güç kaybına yol açan ilerleyici bir nörodejeneratif hastalık.) ile ilişkili farklı RNA-bağlayıcı proteinRNA-bağlayıcı proteinRNA moleküllerine bağlanan ve onların işlevlerini etkileyen proteinler.lerin (TDP-43TDP-43TDP-43 (Transaktif Yanıt DNA Bağlayıcı Protein 43), RNA/DNA işlenmesinde kritik rol oynayan insanlarda TARDBP geni tarafından kodlanan bir proteindir. Sağlıklı hücrelerde çekirdekte bulunurken, ALS ve FTD gibi hastalıklarda sitoplazmada birikerek nörotoksik etki yaratır., FUS, MATR3MATR3ALS ile ilişkili bir RNA-bağlayıcı protein.) alternatif poliadanilasyon (APA)Alternatif Poliadanilasyon (APA)Transkriptlerin 3' ucunun mimarisini, stabilitesini, lokalizasyonunu ve translasyonunu düzenleyen bir süreç. üzerindeki etkilerini araştırmıştır. TDP-43TDP-43TDP-43 (Transaktif Yanıt DNA Bağlayıcı Protein 43), RNA/DNA işlenmesinde kritik rol oynayan insanlarda TARDBP geni tarafından kodlanan bir proteindir. Sağlıklı hücrelerde çekirdekte bulunurken, ALS ve FTD gibi hastalıklarda sitoplazmada birikerek nörotoksik etki yaratır. ve FUS'un farklı genetik modellerinde (knockdownKnockdownBir genin ifadesinin azaltılması., mutasyonel ekspresyon, knockoutKnockoutBir genin işlevini tamamen ortadan kaldırmak veya devre dışı bırakmak için kullanılan genetik bir tekniktir.) APA değişiklikleri incelenmiştir. FUS knockoutKnockoutBir genin işlevini tamamen ortadan kaldırmak veya devre dışı bırakmak için kullanılan genetik bir tekniktir.'un en belirgin APA yanıtını ürettiği, ancak farklı deneyler arasında anlamlı APA olaylarının veya genlerinin paylaşılmadığı gözlemlenmiştir. Daha gevşek istatistiksel kriterler (nominal P < 0.05) kullanıldığında ise, özellikle TDP-43TDP-43TDP-43 (Transaktif Yanıt DNA Bağlayıcı Protein 43), RNA/DNA işlenmesinde kritik rol oynayan insanlarda TARDBP geni tarafından kodlanan bir proteindir. Sağlıklı hücrelerde çekirdekte bulunurken, ALS ve FTD gibi hastalıklarda sitoplazmada birikerek nörotoksik etki yaratır. knockdownKnockdownBir genin ifadesinin azaltılması. ve TDP-43TDP-43TDP-43 (Transaktif Yanıt DNA Bağlayıcı Protein 43), RNA/DNA işlenmesinde kritik rol oynayan insanlarda TARDBP geni tarafından kodlanan bir proteindir. Sağlıklı hücrelerde çekirdekte bulunurken, ALS ve FTD gibi hastalıklarda sitoplazmada birikerek nörotoksik etki yaratır. K263E ekspresyonu arasında belirgin bir nominal olay ve gen örtüşmesi saptanmıştır. FUS knockoutKnockoutBir genin işlevini tamamen ortadan kaldırmak veya devre dışı bırakmak için kullanılan genetik bir tekniktir. ve FUS P525L ekspresyonu arasında da nominal örtüşme görülmüş, ancak yönsel uyum veya korelasyonKorelasyonİki veya daha fazla değişken arasındaki istatistiksel ilişki. bulunmamıştır. Sonuç olarak, APA yanıtlarının evrensel bir kusurdan ziyade, bağlama bağlı kısmi bir yakınsama gösterdiği belirtilmiştir.

Önemli Bulgular: Farklı ALSALSBeyin ve omurilikteki motor sinir hücrelerinin kaybıyla karakterize, kas erimesi ve güç kaybına yol açan ilerleyici bir nörodejeneratif hastalık. ilişkili RNA-bağlayıcı proteinRNA-bağlayıcı proteinRNA moleküllerine bağlanan ve onların işlevlerini etkileyen proteinler.lerin (TDP-43TDP-43TDP-43 (Transaktif Yanıt DNA Bağlayıcı Protein 43), RNA/DNA işlenmesinde kritik rol oynayan insanlarda TARDBP geni tarafından kodlanan bir proteindir. Sağlıklı hücrelerde çekirdekte bulunurken, ALS ve FTD gibi hastalıklarda sitoplazmada birikerek nörotoksik etki yaratır., FUS, MATR3MATR3ALS ile ilişkili bir RNA-bağlayıcı protein.) alternatif poliadanilasyon (APA)Alternatif Poliadanilasyon (APA)Transkriptlerin 3' ucunun mimarisini, stabilitesini, lokalizasyonunu ve translasyonunu düzenleyen bir süreç. üzerindeki etkileri incelenmiştir. FUS knockoutKnockoutBir genin işlevini tamamen ortadan kaldırmak veya devre dışı bırakmak için kullanılan genetik bir tekniktir., en güçlü APA yanıtını üreten model olarak belirlenmiştir. Yüksek istatistiksel güvenilirlik düzeyinde (FDR < 0.05) deneyler arasında anlamlı APA olayı veya gen paylaşımı saptanmamıştır. Daha gevşek istatistiksel kriterler (nominal P < 0.05) kullanıldığında, özellikle TDP-43TDP-43TDP-43 (Transaktif Yanıt DNA Bağlayıcı Protein 43), RNA/DNA işlenmesinde kritik rol oynayan insanlarda TARDBP geni tarafından kodlanan bir proteindir. Sağlıklı hücrelerde çekirdekte bulunurken, ALS ve FTD gibi hastalıklarda sitoplazmada birikerek nörotoksik etki yaratır. modelleri arasında nominal olay ve gen örtüşmesi gözlemlenmiştir. APA yanıtları, evrensel bir kusur yerine, bağlama bağlı kısmi bir yakınsama göstermektedir.