ALS'de m6A-SNP İlişkili Tanısal Biyobelirteçlerin Entegre Çoklu-Omik ile Tanımlanması

Doktor Özeti: Bu çalışma, Amyotrofik Lateral Skleroz (ALS)Amyotrofik Lateral Skleroz (ALS)Amyotrofik lateral skleroz (ALS), beyin ve omurilikteki motor sinir hücrelerinin (nöronlar) kaybı sonucu gelişen, kaslarda güçsüzlük, erime (atrofi) ve istemli hareket kaybına yol açan ilerleyici bir nörodejeneratif hastalıktır. için güvenilir ve minimal invaziv erken tanı biyobelirteçlerinin eksikliğini gidermeyi hedeflemektedir. Araştırmacılar, RNA metilasyonMetilasyonDNA veya proteinlerin işlevini düzenlemek için bir metil grubunun eklenmesi süreci; gen ifadesi ve nörotransmitter sentezi için kritiktir.unu ve gen ekspresyonuGen EkspresyonuBir genin bilgisinin işlevsel bir ürün (protein veya RNA) sentezlemek için kullanıldığı süreç.nu etkileyebilecek m6A ile ilişkili tek nükleotid polimorfizmlerinin (m6A-SNPm6A-SNPRNA metilasyonunu (özellikle N6-metiladenozin, m6A) etkileyebilen, tek nükleotid polimorfizmi (SNP) ile ilişkili genetik varyasyon.'ler) potansiyelini değerlendirmiştir. eQTLGen cis-eQTL verileri, RMVar m6A-SNPm6A-SNPRNA metilasyonunu (özellikle N6-metiladenozin, m6A) etkileyebilen, tek nükleotid polimorfizmi (SNP) ile ilişkili genetik varyasyon. anotasyonları ve ALSALSBeyin ve omurilikteki motor sinir hücrelerinin kaybıyla karakterize, kas erimesi ve güç kaybına yol açan ilerleyici bir nörodejeneratif hastalık. transkriptomik veriTranskriptomik veriBir hücre veya organizmadaki tüm RNA moleküllerinin (transkriptomun) gen ekspresyon profillerini içeren veri. setleri entegre edilerek 109 ALSALSBeyin ve omurilikteki motor sinir hücrelerinin kaybıyla karakterize, kas erimesi ve güç kaybına yol açan ilerleyici bir nörodejeneratif hastalık. ilişkili m6A-SNPm6A-SNPRNA metilasyonunu (özellikle N6-metiladenozin, m6A) etkileyebilen, tek nükleotid polimorfizmi (SNP) ile ilişkili genetik varyasyon. ilişkili gen tanımlanmıştır. Random Forest ve LASSO regresyonuLASSO RegresyonuÖzellik seçimi ve düzenlileştirme amacıyla kullanılan, modelin karmaşıklığını azaltmaya yardımcı olan bir regresyon analizi yöntemi. kullanılarak bu genler yedi aday tanısal belirtece (TMED5, OXR1, BRI3, FEM1C, SUZ12, EIF2AK4 ve TJAP1) daraltılmıştır. Yedi genli modelin eğitim kohortKohortBelirli bir ortak özelliği olan ve belirli bir zaman dilimi boyunca takip edilen hasta veya birey grubu.unda bireysel belirteçlerden daha iyi performans gösterdiği ve bağımsız doğrulama kohortKohortBelirli bir ortak özelliği olan ve belirli bir zaman dilimi boyunca takip edilen hasta veya birey grubu.unda orta düzeyde ayrımcılık sağladığı bulunmuştur. ALSALSBeyin ve omurilikteki motor sinir hücrelerinin kaybıyla karakterize, kas erimesi ve güç kaybına yol açan ilerleyici bir nörodejeneratif hastalık. örneklerinde monositlerMonositlerKanda dolaşan ve dokularda makrofajlara dönüşebilen bir tür beyaz kan hücresi., nötrofiller ve T-hücresi alt kümeleri dahil olmak üzere immün hücre kompozisyonunda farklılıklar gözlenmiştir. Seçilen SNP lokusları, tahmini m6A bölgelerine ve RBP-bağlanma bölgelerine yakın konumlanmıştır. Keşifsel klinik doğrulama, FEM1C ve SUZ12'nin hem mRNA hem de protein seviyelerinde anlamlı yukarı regülasyonunu ve global m6A modifikasyonunda azalmayı göstermiştir. Bu multi-omikMulti-omikGenomik, metabolomik ve proteomik gibi farklı biyolojik veri setlerinin birleştirilerek kapsamlı bir analiz yapılması yöntemi. entegrasyon ve keşifsel klinik doğrulama, ALSALSBeyin ve omurilikteki motor sinir hücrelerinin kaybıyla karakterize, kas erimesi ve güç kaybına yol açan ilerleyici bir nörodejeneratif hastalık. için m6A-SNPm6A-SNPRNA metilasyonunu (özellikle N6-metiladenozin, m6A) etkileyebilen, tek nükleotid polimorfizmi (SNP) ile ilişkili genetik varyasyon. ilişkili aday belirteçleri ortaya koymaktadır. Bulgular, ALSALSBeyin ve omurilikteki motor sinir hücrelerinin kaybıyla karakterize, kas erimesi ve güç kaybına yol açan ilerleyici bir nörodejeneratif hastalık. ayrımı ve moleküler karakterizasyonu için m6A ile ilişkili imzaların daha fazla değerlendirilmesini desteklemekle birlikte, klinik uygulamaKlinik uygulamaLaboratuvar ortamında geliştirilen tıbbi yöntemlerin veya ilaçların, hastalar üzerinde tedavi edici amaçla kullanılması süreci.dan önce daha büyük bağımsız kohortKohortBelirli bir ortak özelliği olan ve belirli bir zaman dilimi boyunca takip edilen hasta veya birey grubu.larda ek kalibrasyon gerekmektedir.

Önemli Bulgular: m6A-SNPm6A-SNPRNA metilasyonunu (özellikle N6-metiladenozin, m6A) etkileyebilen, tek nükleotid polimorfizmi (SNP) ile ilişkili genetik varyasyon.'ler, ALSALSBeyin ve omurilikteki motor sinir hücrelerinin kaybıyla karakterize, kas erimesi ve güç kaybına yol açan ilerleyici bir nörodejeneratif hastalık. için potansiyel tanısal biyobelirteçler olarak tanımlanmıştır. Yedi genli (TMED5, OXR1, BRI3, FEM1C, SUZ12, EIF2AK4, TJAP1) bir modelin ALSALSBeyin ve omurilikteki motor sinir hücrelerinin kaybıyla karakterize, kas erimesi ve güç kaybına yol açan ilerleyici bir nörodejeneratif hastalık. tanısında bireysel belirteçlerden daha iyi performans gösterdiği saptanmıştır. ALSALSBeyin ve omurilikteki motor sinir hücrelerinin kaybıyla karakterize, kas erimesi ve güç kaybına yol açan ilerleyici bir nörodejeneratif hastalık. hastalarında monositlerMonositlerKanda dolaşan ve dokularda makrofajlara dönüşebilen bir tür beyaz kan hücresi., nötrofiller ve T-hücresi alt kümeleri dahil olmak üzere immün hücre kompozisyonunda farklılıklar gözlenmiştir. FEM1C ve SUZ12 genlerinin mRNA ve protein seviyelerinde yukarı regülasyonu ile global m6A modifikasyonunda azalma, keşifsel klinik doğrulama ile desteklenmiştir. Klinik uygulamaKlinik uygulamaLaboratuvar ortamında geliştirilen tıbbi yöntemlerin veya ilaçların, hastalar üzerinde tedavi edici amaçla kullanılması süreci.dan önce daha büyük bağımsız kohortKohortBelirli bir ortak özelliği olan ve belirli bir zaman dilimi boyunca takip edilen hasta veya birey grubu.larda doğrulama ve ek kalibrasyon gereklidir.