ALS'de Transkriptom Tabanlı Makine Öğrenimi ile Tedavi Hedeflerinin ve Yeniden Konumlandırılabilir İlaçların Belirlenmesi

Doktor Özeti: Bu çalışma, sınırlı etkili tedaviTedaviBir hastalığı veya yaralanmayı iyileştirmek için uygulanan tıbbi müdahale. seçenekleri olan heterojenHeterojenÇeşitli bileşenlerden veya öğelerden oluşan; tıpta, birden fazla nedeni veya klinik sunumu olan bir hastalık veya durum için kullanılır. nörodejeneratifNörodejeneratifSinir hücrelerinin ilerleyici kaybı ile karakterize hastalıkları tanımlayan terim. bir hastalık olan Amotrofik Lateral Skleroz'da (ALSALSBeyin ve omurilikteki motor sinir hücrelerinin kaybıyla karakterize, kas erimesi ve güç kaybına yol açan ilerleyici bir nörodejeneratif hastalık.) potansiyel terapötik hedefTerapötik HedefBir hastalığın tedavisinde, ilacın etki etmesi için seçilen spesifik bir molekül, gen veya metabolik yolak.leri ve ilaç yeniden konumlandırma hipotezlerini belirlemeyi amaçlamıştır. Motor korteksmotor korteksBeynin istemli hareketleri kontrol eden bölgesi. (E-MTAB-2325) ve kan (E-TABM-940) kaynaklı iki halka açık transkriptomik veriTranskriptomik veriBir hücre veya organizmadaki tüm RNA moleküllerinin (transkriptomun) gen ekspresyon profillerini içeren veri. seti, makine öğrenimi tabanlı bir konsensüs çerçevesi kullanılarak analiz edilmiştir. Dört özellik seçimi yöntemi ve 100 tekrarlı 4 katlı çapraz doğrulama ile %90 ve üzeri doğruluk sağlayan modellerde tekrarlayan şekilde seçilen problar önceliklendirilmiştir. Elde edilen 15 motor korteksmotor korteksBeynin istemli hareketleri kontrol eden bölgesi. ve 55 kan modeli için, en iyi 100 imza arasında doğrudan örtüşen gen veya prob bulunmamıştır. Ancak, yolak düzeyinde entegrasyon, glial ve immün regülasyon, proteostaz ve vezikül trafiği, MAPK ile ilişkili stres sinyalizasyonu, sitoiskelet ve ekstraselüler yeniden şekillenme ile RNA ile ilişkili süreçleri içeren tamamlayıcı kanıtlar sunmuştur. Motor korteksmotor korteksBeynin istemli hareketleri kontrol eden bölgesi. verileri ayrıca astroglial destek, glutamat işlenmesi ve inklüzyon cisimciği regülasyonunu vurgularken, kan verileri sitokinSitokinBağışıklık sistemi hücreleri tarafından salgılanan, hücreler arası iletişimi ve inflamasyon (iltihap) süreçlerini düzenleyen proteinler. regülasyonu ile yönelimsel olarak heterojenHeterojenÇeşitli bileşenlerden veya öğelerden oluşan; tıpta, birden fazla nedeni veya klinik sunumu olan bir hastalık veya durum için kullanılır. immün, mitokondriMitokondriHücrenin enerji ihtiyacını karşılayan, metabolik süreçlerde merkezi rol oynayan organel.yal ve metabolik sinyalleri öne çıkarmıştır. Deferoksamin ve disülfiram motor korteksmotor korteksBeynin istemli hareketleri kontrol eden bölgesi.te en belirgin geri dönüşümlü profilleri gösterirken, yohimbik asit ve atovaquone kanda geri dönüşümlü profiller sergilemiştir. Siprofloksasin, proklorperazin ve androsteron liderliğindeki bir bileşik grubu ise uyumlu bağlantı göstermiştir. Bu sonuçlar, şeffaf, hipotez üreten gen, yolak ve bileşik öncelikleri sağlamakla birlikte, biyobelirteç, terapötikTerapötikHastalıkların iyileştirilmesi veya semptomların hafifletilmesi amacıyla uygulanan tedavi edici yöntemler. etkinlik veya klinik uygunluk oluşturmamakta ve bağımsız kohortKohortBelirli bir ortak özelliği olan ve belirli bir zaman dilimi boyunca takip edilen hasta veya birey grubu.larda ve deneysel ALSALSBeyin ve omurilikteki motor sinir hücrelerinin kaybıyla karakterize, kas erimesi ve güç kaybına yol açan ilerleyici bir nörodejeneratif hastalık. modellerinde doğrulanmayı gerektirmektedir.

Önemli Bulgular: ALSALSBeyin ve omurilikteki motor sinir hücrelerinin kaybıyla karakterize, kas erimesi ve güç kaybına yol açan ilerleyici bir nörodejeneratif hastalık.'de ilaç yeniden konumlandırma için transkriptomTranskriptomBir hücre veya dokuda belirli bir zamanda sentezlenen tüm RNA moleküllerinin (mRNA, tRNA, rRNA vb.) tamamı. çapında makine öğrenimi tabanlı yeni bir konsensüs yaklaşımı kullanılmıştır. Motor korteksmotor korteksBeynin istemli hareketleri kontrol eden bölgesi. ve kan transkriptomik veriTranskriptomik veriBir hücre veya organizmadaki tüm RNA moleküllerinin (transkriptomun) gen ekspresyon profillerini içeren veri.leri, ALSALSBeyin ve omurilikteki motor sinir hücrelerinin kaybıyla karakterize, kas erimesi ve güç kaybına yol açan ilerleyici bir nörodejeneratif hastalık. ile ilişkili farklı ama tamamlayıcı yolakları ve genetik imzaları ortaya koymuştur. Çeşitli mevcut ilaçlar (deferoksamin, disülfiram, yohimbik asit, atovaquone, siprofloksasin, proklorperazin, androsteron grubu) potansiyel terapötikTerapötikHastalıkların iyileştirilmesi veya semptomların hafifletilmesi amacıyla uygulanan tedavi edici yöntemler. adaylar olarak belirlenmiştir. Bu sonuçlar hipotez üreticidir ve biyobelirteç, terapötikTerapötikHastalıkların iyileştirilmesi veya semptomların hafifletilmesi amacıyla uygulanan tedavi edici yöntemler. etkinlik veya klinik uygunluk kanıtı değildir; bağımsız kohortKohortBelirli bir ortak özelliği olan ve belirli bir zaman dilimi boyunca takip edilen hasta veya birey grubu.larda ve deneysel ALSALSBeyin ve omurilikteki motor sinir hücrelerinin kaybıyla karakterize, kas erimesi ve güç kaybına yol açan ilerleyici bir nörodejeneratif hastalık. modellerinde daha fazla doğrulama gereklidir.