Bütünleşik Ağ Farmakolojisi ve Moleküler Doklama Analizi Pterostilbene'in Nörodejeneratif Hastalıklardaki Çok Hedefli Mekanizmalarını Ortaya Çıkarıyor

Doktor Özeti: Bu çalışmada, doğal bir stilben olan Pterostilbenin (PTR) Alzheimer hastalığı (AD), Parkinson hastalığıParkinson HastalığıBeyindeki dopamin üreten hücrelerin kaybıyla ortaya çıkan, titreme, hareketlerde yavaşlama, kas sertliği ve denge bozukluğu ile seyreden kronik bir sinir sistemi hastalığı. (PD), Huntington hastalığı (HD) ve amiyotrofik lateral skleroz (ALSALSBeyin ve omurilikteki motor sinir hücrelerinin kaybıyla karakterize, kas erimesi ve güç kaybına yol açan ilerleyici bir nörodejeneratif hastalık.) gibi nörodejeneratifNörodejeneratifSinir hücrelerinin ilerleyici kaybı ile karakterize hastalıkları tanımlayan terim. süreçlerdeki potansiyel hedefleri ve biyolojik mekanizmaları in silicoIn silicoBilgisayar simülasyonu veya modellemesi yoluyla gerçekleştirilen deney veya analiz yöntemi. yöntemlerle araştırılmıştır. Ağ farmakolojisi, protein-protein etkileşimi (PPI), GO Biyolojik Süreç (GO BP) zenginleştirmesi, moleküler doklama ve 500 ns moleküler dinamik (MD) simülasyonları entegre edilmiştir. Analiz sonucunda AD için 181, PD için 165, HD için 128 ve ALSALSBeyin ve omurilikteki motor sinir hücrelerinin kaybıyla karakterize, kas erimesi ve güç kaybına yol açan ilerleyici bir nörodejeneratif hastalık. için 109 ortak PTR-hastalık hedefi tanımlanmıştır. GO BP verileri; nöroinflamasyon, reaktif oksijen türleri ve oksidatif stres yanıtları, programlanmış hücre ölümüProgramlanmış Hücre ÖlümüHücrenin genetik kontrol altında kendi kendini imha etmesiyle sonuçlanan düzenli hücre ölümü mekanizması., MAPK/ERK ile PI3K/AKT sinyal yolları, iyon/kalsiyum taşınması ve lipid/steroid/hormon düzenlemeleriyle ilişki göstermiştir. Topolojik analizlerde SRC, ESR1ESR1Östrojen reseptörü 1 proteinini ifade eden ve çalışmada PTR ile en elverişli etkileşim profilini gösteren hedef molekül. ve HSP90AA1HSP90AA1Isı şoku proteini 90 alfa ailesine ait, protein katlanması ve hücresel stres yanıtlarında görev alan hub-bottleneck protein. tekrarlayan hub-bottleneck proteinler olarak belirlenmiş; MD simülasyonlarında PTR'nin ESR1ESR1Östrojen reseptörü 1 proteinini ifade eden ve çalışmada PTR ile en elverişli etkileşim profilini gösteren hedef molekül. ve HSP90AA1HSP90AA1Isı şoku proteini 90 alfa ailesine ait, protein katlanması ve hücresel stres yanıtlarında görev alan hub-bottleneck protein. ile kararlı etkileşim kurduğu, en elverişli tahmin profilinin ise ESR1ESR1Östrojen reseptörü 1 proteinini ifade eden ve çalışmada PTR ile en elverişli etkileşim profilini gösteren hedef molekül.'de olduğu saptanmıştır. Bulgular tamamen hesaplamalı (computational) olup hipotez üretme niteliğindedir.

Önemli Bulgular: Pterostilben (PTR); antioksidan, antiinflamatuar ve nörokoruyucu özelliklere sahip doğal bir bileşiktir. İn silico analizler sonucunda AD için 181, PD için 165, HD için 128 ve ALSALSBeyin ve omurilikteki motor sinir hücrelerinin kaybıyla karakterize, kas erimesi ve güç kaybına yol açan ilerleyici bir nörodejeneratif hastalık. için 109 ortak PTR-hastalık hedefi belirlenmiştir. PTR hedeflerinin nöroinflamasyon, reaktif oksijen türleri (ROS)Reaktif Oksijen Türleri (ROS)Hücre hasarına neden olabilen, oksijen içeren moleküllerdir. Serbest radikaller ve peroksitler gibi çeşitli formlarda bulunurlar. yanıtları, programlanmış hücre ölümüProgramlanmış Hücre ÖlümüHücrenin genetik kontrol altında kendi kendini imha etmesiyle sonuçlanan düzenli hücre ölümü mekanizması., MAPK/ERK ve PI3K/AKT sinyal yolları ile ilişkili olduğu görülmüştür. SRC, ESR1ESR1Östrojen reseptörü 1 proteinini ifade eden ve çalışmada PTR ile en elverişli etkileşim profilini gösteren hedef molekül. ve HSP90AA1HSP90AA1Isı şoku proteini 90 alfa ailesine ait, protein katlanması ve hücresel stres yanıtlarında görev alan hub-bottleneck protein. anahtar proteinler (hub-bottleneck) olarak öne çıkmış; 500 ns MD simülasyonlarında en uygun etkileşim ESR1ESR1Östrojen reseptörü 1 proteinini ifade eden ve çalışmada PTR ile en elverişli etkileşim profilini gösteren hedef molekül. ile gözlenmiştir. Çalışma tamamen bilgisayar simülasyonlarına dayanmakta olup deneysel doğrulama gerektirmektedir.