ALS Tanısı için Hedefli RNA-Seq Geliştirilmesi

Amyotrofik Lateral Skleroz (ALS)Amyotrofik Lateral Skleroz (ALS)Amyotrofik lateral skleroz (ALS), beyin ve omurilikteki motor sinir hücrelerinin (nöronlar) kaybı sonucu gelişen, kaslarda güçsüzlük, erime (atrofi) ve istemli hareket kaybına yol açan ilerleyici bir nörodejeneratif hastalıktır. için genetik tanı, hedefe yönelik tedaviTedaviBir hastalığı veya yaralanmayı iyileştirmek için uygulanan tıbbi müdahale. yollarını açma potansiyeline sahiptir. Ancak, birçok ailesel ALSALSBeyin ve omurilikteki motor sinir hücrelerinin kaybıyla karakterize, kas erimesi ve güç kaybına yol açan ilerleyici bir nörodejeneratif hastalık. formu genetik olarak tanı alamamakta veya tespit edilen varyantVaryantBir genin veya DNA dizisinin popülasyonda görülen, normalden farklı olan bir versiyonu veya formu. Genetik varyantlar hastalık riskini veya seyrini etkileyebilir.ların (VUS) klinik anlamı belirsiz kalmaktadır. Özellikle eklenmeyi (splicing) etkileyen bu varyantVaryantBir genin veya DNA dizisinin popülasyonda görülen, normalden farklı olan bir versiyonu veya formu. Genetik varyantlar hastalık riskini veya seyrini etkileyebilir.ların patojenik doğrulukları, in silicoIn silicoBilgisayar simülasyonu veya modellemesi yoluyla gerçekleştirilen deney veya analiz yöntemi. araçlarla tahmin edilse de, yalnızca hastanın RNA analizi ile kesinleşebilir. Mevcut moleküler tanı süreci, C9ORF72 geniC9orf72 geniALS ve frontotemporal demans (FTD) ile ilişkili en yaygın genetik mutasyonlardan biri olan, kromozom 9 üzerinde yer alan bir gen.ndeki GGGGCC genişlemesinin RP-PCR ile aranması ve ardından ALSALSBeyin ve omurilikteki motor sinir hücrelerinin kaybıyla karakterize, kas erimesi ve güç kaybına yol açan ilerleyici bir nörodejeneratif hastalık. ile ilişkili 30 genlik bir panelin yüksek verimli dizilemeDizilemeDNA veya RNA gibi nükleik asitlerin baz dizilimini belirleme süreci. (NGS) ile analizini içermektedir. Eklenmeyi etkileyen varyantVaryantBir genin veya DNA dizisinin popülasyonda görülen, normalden farklı olan bir versiyonu veya formu. Genetik varyantlar hastalık riskini veya seyrini etkileyebilir.ların doğrulanması için kullanılan RT-PCR ve Sanger dizilemeDizilemeDNA veya RNA gibi nükleik asitlerin baz dizilimini belirleme süreci. yöntemleri, zaman alıcı, özelleştirilmiş ve mutasyon/gen/hasta bağımlı dezavantajlara sahiptir. Bu çalışma, yüksek verimli RNA dizilemeDizilemeDNA veya RNA gibi nükleik asitlerin baz dizilimini belirleme süreci.nin (RNA-SeqRNA-SeqRNA dizileme, bir RNA örneğindeki nükleotid dizisini belirleme işlemidir. Gen ekspresyonunu incelemek için kullanılır.) bu sınırlamaları aşarak çok sayıda genin eklenmesini eş zamanlı ve global bir yaklaşımla analiz edebileceğini öne sürmektedir. RNA-SeqRNA-SeqRNA dizileme, bir RNA örneğindeki nükleotid dizisini belirleme işlemidir. Gen ekspresyonunu incelemek için kullanılır., özelleştirilmiş primer tasarımına gerek kalmadan tüm transkriptlerTranskriptlerDNA'dan RNA'ya kopyalanmış genetik bilgi molekülleri; gen ekspresyonunun bir göstergesi.i yakalar ve ekson atlaması, intron dahil edilmesi ve füzyon transkriptlerTranskriptlerDNA'dan RNA'ya kopyalanmış genetik bilgi molekülleri; gen ekspresyonunun bir göstergesi.i gibi ek bilgiler sağlar. GTEx projesi verilerine göre, Nîmes Üniversite Hastanesi'nde rutin olarak analiz edilen 30 ALSALSBeyin ve omurilikteki motor sinir hücrelerinin kaybıyla karakterize, kas erimesi ve güç kaybına yol açan ilerleyici bir nörodejeneratif hastalık. geninden 25'inin RNA-SeqRNA-SeqRNA dizileme, bir RNA örneğindeki nükleotid dizisini belirleme işlemidir. Gen ekspresyonunu incelemek için kullanılır. ile tam analize uygun olduğu belirtilmiştir. Fransa'da henüz hiçbir laboratuvarın RNA-SeqRNA-SeqRNA dizileme, bir RNA örneğindeki nükleotid dizisini belirleme işlemidir. Gen ekspresyonunu incelemek için kullanılır.'i rutin ALSALSBeyin ve omurilikteki motor sinir hücrelerinin kaybıyla karakterize, kas erimesi ve güç kaybına yol açan ilerleyici bir nörodejeneratif hastalık. tanısında kullanmadığı göz önüne alındığında, yılda 600'den fazla genetik tanı talebi alan bu laboratuvarın amacı, ALSALSBeyin ve omurilikteki motor sinir hücrelerinin kaybıyla karakterize, kas erimesi ve güç kaybına yol açan ilerleyici bir nörodejeneratif hastalık. genlerinin RNA transkriptlerTranskriptlerDNA'dan RNA'ya kopyalanmış genetik bilgi molekülleri; gen ekspresyonunun bir göstergesi.ini analiz etmek için global bir yöntem geliştirerek mutasyonları kategorize etmek ve hastaların tanısal yönetimini iyileştirmektir.

Önemli Takip Edilecek Noktalar:

• ALSALSBeyin ve omurilikteki motor sinir hücrelerinin kaybıyla karakterize, kas erimesi ve güç kaybına yol açan ilerleyici bir nörodejeneratif hastalık.'nin genetik tanısında belirsiz anlamlı varyantVaryantBir genin veya DNA dizisinin popülasyonda görülen, normalden farklı olan bir versiyonu veya formu. Genetik varyantlar hastalık riskini veya seyrini etkileyebilir.lar (VUS) ve eklenme (splicing) sorunları önemli bir zorluk teşkil etmektedir.
• Mevcut VUS doğrulama yöntemleri (RT-PCR ve Sanger dizilemeDizilemeDNA veya RNA gibi nükleik asitlerin baz dizilimini belirleme süreci.) zaman alıcı, özelleştirilmiş ve sınırlamalara sahiptir.
• Yüksek verimli RNA dizilemeDizilemeDNA veya RNA gibi nükleik asitlerin baz dizilimini belirleme süreci. (RNA-SeqRNA-SeqRNA dizileme, bir RNA örneğindeki nükleotid dizisini belirleme işlemidir. Gen ekspresyonunu incelemek için kullanılır.), ALSALSBeyin ve omurilikteki motor sinir hücrelerinin kaybıyla karakterize, kas erimesi ve güç kaybına yol açan ilerleyici bir nörodejeneratif hastalık. genlerinin eklenmesini global ve kapsamlı bir şekilde analiz ederek tanısal verimliliği artırma potansiyeline sahiptir.
• RNA-SeqRNA-SeqRNA dizileme, bir RNA örneğindeki nükleotid dizisini belirleme işlemidir. Gen ekspresyonunu incelemek için kullanılır., ekson atlaması, intron dahil edilmesi ve füzyon transkriptlerTranskriptlerDNA'dan RNA'ya kopyalanmış genetik bilgi molekülleri; gen ekspresyonunun bir göstergesi.i gibi DNADNACanlıların genetik bilgisini taşıyan ve kalıtımı sağlayan nükleik asittir. dizilemeDizilemeDNA veya RNA gibi nükleik asitlerin baz dizilimini belirleme süreci. ile elde edilemeyen ek bilgiler sunar.
• Çalışmanın amacı, ALSALSBeyin ve omurilikteki motor sinir hücrelerinin kaybıyla karakterize, kas erimesi ve güç kaybına yol açan ilerleyici bir nörodejeneratif hastalık. genlerinin RNA transkriptlerTranskriptlerDNA'dan RNA'ya kopyalanmış genetik bilgi molekülleri; gen ekspresyonunun bir göstergesi.ini analiz etmek için global bir yöntem geliştirerek mutasyonları kategorize etmek ve hastaların tanısal yönetimini iyileştirmektir.
• Fransa'da RNA-SeqRNA-SeqRNA dizileme, bir RNA örneğindeki nükleotid dizisini belirleme işlemidir. Gen ekspresyonunu incelemek için kullanılır. henüz rutin ALSALSBeyin ve omurilikteki motor sinir hücrelerinin kaybıyla karakterize, kas erimesi ve güç kaybına yol açan ilerleyici bir nörodejeneratif hastalık. tanısında kullanılmamaktadır, ancak bu çalışma bu yönde bir adım atmayı hedeflemektedir.